CCER項目開發流程主要包含兩個方面：第一，項目登記流程；第二，項目減排量登記流程；主要包括8個步驟，依次是：項目設計，項目公示，項目審定，項目登記，項目實施、監測及減排量核算，減排量公示，減排量核查，減排量登記。

項目登記流程是注冊登記機構確認該項目是否符合CCER項目申請的所有資格條件的過程。項目登記主要分為以下流程：

A. 編寫CCER項目設計文件；

B. 通過注冊登記系統公示項目設計文件

C. 委托審定與核查機構對項目設計文件進行審定；

D. 修改項目設計文件；

E. 審定與核查機構出具項目審定報告；

F. 項目登記申請材料提交到注冊登記機構申請項目登記；

項目減排量登記是項目登記后，對該CCER項目實施后的減排量的核證流程。項目減排量登記主要分為以下流程：

A. 編寫CCER項目減排量核算報告；

B. 通過注冊登記系統公示減排量核算報告；

C. 委托具有資質的審定與核查機構對項目減排量進行核查；

D. 修改減排量核算報告；

E. 審定與核查機構出具減排量核查報告；

F. 項目減排量申請材料提交到注冊登記機構申請項目減排量登記。